(продолжение)
 То, что файл /opt/extras.ubuntu.com/my-weather-indicator/bin/my-weather-indicator - скрипт(сценарий Python), не имеет никакого значения для его запуска что щелком по файлу, что при внесении его в Запускаемые приложения для автозапуска при загрузке сессии. 
 Важно только чтобы он имел в свойствах файла статус "Позволять выполнение файла как программы".  
 Относительно автозапуска: строки запуска индикатора в окне Заускаемые приложения, файла my-weather-indicator-autostart.desktop в папке ~/.config/autostart и его содержимого. 
 В процессе "опытов" и моделирования возможных ситуаций при которых автозапуск индикатора не работает получилось смоделировать 2 случая(может быть их и больше):
 1. По какой-то причине, независимо от выставленной "галочки" в окне Заускаемые приложения для автозапуска индикатора, в содержимом файла ~/.config/autostart/my-weather-indicator-autostart.desktop не меняется строка X-GNOME-Autostart-enabled=false на X-GNOME-Autostart-enabled=true. 
 (Есть подозрение что система вносит такое изменение в какой-то другой скрытый дублирующий новосозданный файл с аналогичным именем но скрытый и невидимый в Nemo даже при включении режима показа скрытых файлов, но такой файл обнаружился при просмотре каталога ~/.config/autostart/ в mc при включении режима показа скрытых, резервных и пр .
 То есть в mc я видел два почти одинаковых файла имеющих различие только то, 
 что в одном было X-GNOME-Autostart-enabled=false ,
 а в другом X-GNOME-Autostart-enabled=true. )  
 2. При выставленной "галочке" в окне Заускаемые приложения для автозапуска индикатора, в содержимом файла ~/.config/autostart/my-weather-indicator-autostart.desktop 
 была строка X-GNOME-Autostart-enabled=true, но программа всё равно не запускалась.
 Такое наблюдалось если в настройках индикатора был отключен показ виджета и показ индикатора в панели задач. Эти показы отключены в настройках по умолчанию. 
 Для исправления ситуации
 в первом случае, можно удалив все файлы от weather-indicator в ~/.config/autostart/ , запустить из меню программу индикатора и в её настройках снова установить автозапуск.
 Или вручную внести запись на автозапуск индикатора в окне Заускаемые приложения, удалив нём автосозданную строку.  
 во втором случае, надо поменять настройки индикатора и включить показ виджета и показ индикатора. Но тут есть нюанс- окно настроек автоматически открывается только при первом запуске программы, а далее его можно открыть только при открытии окна по клику по значку индикатора на панели, который отключен. Для включения показа индикатора на панели можно вручную отредактировать файл конфигурации индикатора - 
 ~/.config/my-weather-indicator/my-weather-indicator.conf  
| sizonov stas: | 
| подымите руку вверх, у кого индикатор работает "искаропки" | 
 у меня. 
 при установке минт17.1mate. Да и минт17.1 cinnamon пока "опыты" проводил, больше десятка раз ставил-сносил и пр. и только 2 раза сам не понял по какой точно причине "глюканул" автозапуск. Первый раз в торопях что-то нащёлкал и долго не мог включить настройки из меню, и как получилось второй раз с "неуправляемым" файлом в папке автостарта, тоже не понял. 
 Если всё ставить по порядку и ничего не забыть включить то всё нормально работает. Даже в минт KDE. 
 Единственное что в минтKDE пришлось нестандартно делать , так это первый запуск программы, ввиду отсутствия строки в меню. 
 Запустить можно хоть командой в терминале 
 $ /opt/extras.ubuntu.com/my-weather-indicator/bin/my-weather-indicator 
 хоть кликом по этому файлику в файловом менеджере  
 А вот в минт17 с xfce , вроде ставится, но нет ни строчки в меню и при запуске через терминал говорит что некоторых необходимых модулей нет.  
| sizonov stas: | 
| colonel: |  | Всё и так нормально запускается и всё работает без допскриптов и прочего колдовства с питоном |    у меня не работает, иначе бы не создавал тему    насчёт "сомнительной причины" уже отписался, она и мне кажется сомнительной   | 
 тут и сомневаться не надо, достаточно проверить кликом по этому файлику или командой через терминал или попробуйте - удалите /usr/bin/python3 в "скрипте для запуска скрипта". 
 Проверял и на установленной системе и на системах загруженных в лайфрежиме с флешки. 
 Вы показывали содержимое файла my-weather-indicator-autostart.desktop в папке автозапуска. В нём запуск программы запрещён.